Revisió de les proves genètiques en pacients amb malaltia renal: rendiment diagnòstic de variants de nucleòtids únics i variacions del nombre de còpies avaluades a través i dins dels grups de fenotips renals Ⅱ

4 | DISCUSSIÓ

Determinar el veritable rendiment diagnòstic a partir dels articles estudiats és difícil a causa de la variabilitat en les característiques del pacient, la cohort i les proves. Per tant, el rendiment diagnòstic dels diferents grups de fenotips s'ha de pensar en termes d'intervals i les recomanacions no s'han de basar en estudis únics. Donada l'enorme variació dels paràmetres clau, hem volgut evitar la sobreinterpretació i, per tant, no hem realitzat anàlisis estadístiques. Tanmateix, la visió general completa que es presenta ajudarà a ponderar els possibles factors rellevants amb informació potencialment útil per a la pràctica clínica. Aquesta visió general permet als metges jutjar quins estudis són més rellevants per als seus pacients/grups de pacients específics i estimar una probabilitat a priori de trobar una causa genètica per als seus pacients.

FIGURA 3 Diagrames de dispersió i diagrames de caixa que mostren la relació entre el rendiment diagnòstic i les característiques de la cohort. (a) Els diagrames de dispersió mostren la relació entre el rendiment diagnòstic i el nombre de casos seqüenciats dins d'un estudi específic. La llegenda descriu una sèrie d'estudis per als quals es disposava de dades sobre aquesta característica de cohort. Els colors indiquen el grup de malalties del qual es van derivar els estudis. Cada punt representa per a un estudi quin era el nombre de casos seqüenciats en aquesta cohort i quin rendiment diagnòstic es va obtenir d'aquest mateix estudi. (b) Boxplots que representen el rendiment diagnòstic en cohorts clíniques versus cohorts de recerca. La meitat inferior mostra cohorts clíniques versus investigacions dels diferents grups de malalties. La llegenda descriu una sèrie d'estudis per als quals es disposava de dades sobre aquesta característica de cohort.

No en va, vam trobar que el rendiment diagnòstic era més alt en funció de les característiques esperades del pacient (p. ex., antecedents familiars, consanguinitat, característiques extrarenals i edat d'inici jove) dins dels estudis. Quan es van avaluar aquestes mateixes característiques en funció del rendiment diagnòstic entre els diferents estudis (en comptes de dins d'un estudi), aquest patró no es va veure per a la consanguinitat i l'edat jove d'inici. Això es podria explicar per una combinació d'altres característiques que tenen un impacte més gran en el rendiment diagnòstic. A més, dins del grup d'inici d'adults, hi ha una gran variació en la gravetat de la malaltia (p. ex., l'ESKD als 20 anys té un rendiment diagnòstic més alt que l'ESKD als 70 anys) i la probabilitat de trobar una causa monogènica (és a dir, en un ADPKD típic). s'espera un alt rendiment diagnòstic de la cohort (figura 2e)). Vam trobar una indicació que l'edat jove d'inici està relacionada amb un rendiment diagnòstic més elevat basat només en els CNV (figura 2f). Això probablement s'explica perquè l'anàlisi CNV de tot el genoma es realitza amb més freqüència en aquest grup (taula suplementària 3).

FES CLIC AQUÍ PER CONÈIXER UNA FORMULACIÓ A HERBES DE CISTANCHE PER A LA FUNCIÓ RENOLÓ I SEXUAL

Aquesta revisió inclou una visió general del rendiment de CNV per fenotip. Els CNV que no es recullen mitjançant la seqüenciació regular es poden avaluar mitjançant una prova independent (per exemple, SNP-array) o mitjançant una eina de trucada CNV basada en dades de seqüenciació (Knoers et al., 2022). Els diferents tipus de proves que es van utilitzar en els estudis inclosos van variar molt, així com el nombre de gens que es van analitzar (és a dir, que cobreixen un gen, el panell multigènic sol·licitat o a tot l'exoma/genoma i l'impacte que això té en el rendiment diagnòstic). [Taula suplementària 3, figura suplementària 3]). Hem trobat la contribució més alta dels CNV al rendiment diagnòstic en CAKUT, ciliopaties i tubulopaties. No obstant això, a tots els grups de fenotips on es van realitzar proves de CNV, els CNV van contribuir al rendiment diagnòstic i s'ha de tenir en compte l'anàlisi de CNV quan es realitzen les proves genètiques. L'elevada contribució dels CNV al rendiment diagnòstic en pacients amb CAKUT confirma informes anteriors (Knoers et al., 2022). Els CNV es van investigar àmpliament en pacients amb CAKUT, ja que el rendiment de SNV és relativament baix en aquest grup. Encara s'ha d'establir per a alguns altres fenotips si el rendiment diagnòstic basat en els CNV està subestimat fins ara, ja que vam trobar que en molts grups de fenotips no es van investigar els CNV (figura 1c).

Sorprenentment, un nombre més elevat de gens provats no sempre es correlacionava amb un rendiment més alt. En teoria, aquest seria sempre el cas en cohorts comparables. Tanmateix, les cohorts que hem estudiat varien clarament. D'una banda, descrivim cohorts amb una causa monogènica molt probable (com pacients amb sospita d'ADPKD) que només requereixen un nombre reduït de gens provats per donar lloc a un alt rendiment diagnòstic. D'altra banda, trobem un menor rendiment diagnòstic i un augment del nombre de gens provats en cohorts menys sospitoses. La mida de la cohort no semblava correlacionar-se amb una sèrie de gens provats (dades no mostrades). Una altra explicació d'aquesta troballa és un augment del nombre de gens provats en pacients on les proves de gens de malalties conegudes comuns no van donar lloc a un diagnòstic genètic. Com que és possible que una proporció d'aquests casos no resolts tinguin un diagnòstic genètic en un gen encara no descobert, o bé una causa no monogènica que explica la seva malaltia, es pot hipotetitzar un rendiment inferior en aquest grup. A més, en algunes cohorts, es van excloure pacients amb mutacions conegudes, però no es va informar del nombre total d'aquests pacients amb una mutació (Bekheirnia et al., 2017; Braun et al., 2016; Faure et al., 2016; Heidet et al., 2016; al., 2017; Kohl et al., 2014; Schueler et al., 2016; Vivante et al., 2017; Ziyadov et al., 2021). Finalment, en alguns estudis, no es van realitzar proves genètiques en gens coneguts específics (p. ex., gens CAKUT coneguts (Caruana et al., 2015; Sanna-Cherchi et al., 2012)). Per traduir el rendiment diagnòstic informat a la pràctica clínica, és important conèixer aquests detalls. Estava fora de l'abast d'aquesta revisió analitzar si per a totes les cohorts la composició del panell incloïa tots els gens causals coneguts, inclosos els gens de fenocòpia adequats, per a cada fenotip en el moment en què es va realitzar l'estudi específic.

FIGURA 4 Diagrames de dispersió i diagrames de caixa que mostren la relació entre el rendiment diagnòstic i les característiques de la prova. ( a ) Gràfics de dispersió que mostren la relació entre el rendiment diagnòstic i el nombre de gens seqüenciats dins d'un estudi específic. La llegenda descriu una sèrie d'estudis per als quals es disposava de dades sobre aquesta característica de prova específica. No es van incloure tots els estudis, ja que en alguns estudis el nombre de gens seqüenciats era diferent dins de l'estudi. Els colors indiquen el grup de malalties del qual es va derivar l'estudi. Cada punt representa per a un estudi quin era el nombre de casos seqüenciats en aquesta cohort i quin rendiment diagnòstic es va obtenir d'aquest mateix estudi. (b) Gràfics circulars que visualitzen una sèrie d'estudis que van realitzar proves de variant de nucleòtid únic (SNV) o de variació de nombre de còpies (CNV) o ambdues. (c) Boxplots que representen el rendiment diagnòstic en relació amb el tipus de variants que s'han provat. Al tauler dret, es divideix en diferents grups de malalties.

Vam trobar que el rendiment diagnòstic va disminuir en cohorts més grans. Això es podria explicar perquè les cohorts més petites estan més clarament definides i, per tant, tenen una sospita més alta d'una causa monogènica. A més del biaix de selecció dins d'un estudi, el biaix de publicació també podria explicar aquesta troballa. Les cohorts més grans probablement donen una estimació més fiable del veritable rendiment diagnòstic en un entorn relativament no seleccionat.malaltia de ronyópoblació. Ens agradaria assenyalar que una cohort publicada amb un alt rendiment diagnòstic no és necessàriament la "millor" cohort per utilitzar per a la presa de decisions clíniques. Quan s'apliquen criteris estrictament restringits, és probable que es passin a faltar diagnòstics genètics. A l'hora d'interpretar les cohorts publicades per a la pràctica clínica, també s'ha de tenir en compte que hi ha moltes diferències locals en el fenotipat i el diagnòstic clínics, especialment quan es veuen des d'una perspectiva internacional. Per exemple, un pacient amb ERC desconeguda en un centre pot diferir clarament d'un pacient amb ERC desconeguda en un altre centre.

Teníem curiositat per saber si trobaríem un rendiment més alt en les cohorts de recerca o en les cohorts de diagnòstic, tot i que la distinció entre aquestes dues no sempre es va descriure clarament. Es podria suposar que el biaix de selecció és més alt en les cohorts de recerca, la qual cosa resulta en un rendiment més alt. Tanmateix, les cohorts de recerca sovint es reuneixen al llarg de diversos anys i el fenotipat no sempre és correcte. A l'hora d'interpretar publicacions sobre cohorts d'investigació, s'ha de tenir en compte que l'accés a la informació clínica i la interpretació de variants, incloses les oportunitats de segregació de variants, poden diferir d'un entorn de diagnòstic clínic i probablement són menys individualitzats. Les cohorts clíniques podrien ser més fiables per obtenir un rendiment diagnòstic que es pugui generalitzar a un entorn diagnòstic. Tanmateix, els metges també podrien perdre casos als quals s'haurien d'oferir proves genètiques. A més, pot faltar informació sobre la població d'origen de la qual es va derivar una cohort en les cohorts clíniques, especialment quan la cohort clínica descriu el rendiment diagnòstic en un centre genètic. Hem trobat que el rendiment diagnòstic entre els dos tipus de cohorts no difereix clarament. Per als estudis de qualsevol tipus de cohort, es desconeix si hi ha una sobrerepresentació o una infrarepresentació dels casos genètics. Realitzant un estudi que realment ho prova totpacients amb malaltia renalen un entorn clínic respondria aquesta pregunta

FIGURA 5 El 50% superior del rendiment diagnòstic s'explica per un nombre limitat de gens i/o variacions del nombre de còpies (CNV). (a) Els gràfics de sectors visualitzen una sèrie de gens responsables del 50% superior del rendiment. La llegenda de l'esquerra descriu per a cada categoria del gràfic circular el nombre d'estudis identificats amb aquest nombre de gens. Entre parèntesis de la dreta hi ha el nombre d'estudis que van informar sobre els gens causals del 50% superiors i separats per "j" el nombre de gens responsables del 50% superior d'aquest fenotip específic. ( b ) Els gens que constituïen aquest 50% en cada estudi per grup de fenotips es mostren aquí tret que els gens fossin responsables només d'un cas positiu i/o de diversos gens constituïts pels percentatges finals. * Les variants de la regió de repeticions en tàndem de gran nombre variable de MUC1 solen perdre's per seqüenciació massiva paral·lela

Per obtenir un rendiment diagnòstic mínim per a un entorn de diagnòstic específic, vam extrapolar el rendiment diagnòstic a la cohort més gran de la qual es va derivar la cohort (clínica) provada. Un exemple interessant d'això el presenten els estudis de Snoek et al. i Schrezenmeier et al., que tots dos informen d'un rendiment diagnòstic del 21% en atrasplantament de ronyócohort (en llista d'espera) (Schrezenmeier et al., 2021; Snoek et al., 2022).

5|IMPACTE DEL DIAGNÒSTIC GENÈTIC

Un diagnòstic genètic pot tenir un impacte en el diagnòstic, el pronòstic i el tractament. Els estudis que hem seleccionat per a la revisió ho destaquen (taula 3). Múltiples estudis van informar sobre el diagnòstic genètic molecular que van donar com a resultat la correcció del diagnòstic clínic. Tot i que els percentatges varien entre aquests diferents estudis, tots destaquen la importància potencial d'establir el diagnòstic correcte mitjançant proves genètiques. L'impacte terapèutic varia des de la derivació i l'avaluació de característiques extrarenals prèviament no reconegudes fins a un canvi de plans de tractament. Un exemple clar de les conseqüències terapèutiques de les proves genètiques és el SRNS; la majoria de les formes genètiques de SRNS no responen als fàrmacs immunosupressors i, per tant, es poden estalviar la toxicitat potencial d'aquests medicaments ineficaços. Un exemple clar d'impacte pronòstic és una recurrència extremadament baixa de la malaltia en moltes malalties renals genètiques següentstrasplantament de ronyóal contrari demalalties renalsamb una causa no genètica.

És important destacar que identificar una causa genètica pot ser crucial per al pacient i/o els pares d'un pacient pel que fa a l'assessorament genètic; informa els riscos de recurrència i pot donar suport a la presa de decisions dels pacients i dels pares sobre opcions reproductives com el diagnòstic genètic prenatal i preimplantacional. A més, es pot assessorar els membres de la família sobre el risc de malaltia, les proves presimptomàtiques i les opcions de detecció de signes secundaris en membres de la família de primer grau mentre no realitzen proves genètiques. Un diagnòstic genètic també pot ser important per viuredonació de ronyonsper membres de la família. L'impacte que tingui un diagnòstic genètic, inclòs l'impacte terapèutic, dependrà del fenotip, però també de les circumstàncies individuals d'un pacient i la seva família, i de la disponibilitat local/regional de tractament i opcions de planificació familiar.

FIGURA 6 Resum de les conclusions clau de la revisió de la literatura (n=115 articles). El costat esquerre de la figura resumeix les característiques que influeixen en el rendiment diagnòstic i l'impacte d'un diagnòstic genètic. La part dreta d'aquesta figura resumeix els missatges clau addicionals per portar a casa. * Els autors d'aquesta revisió han estimat que això es deu a criteris de fenotip molt restringits.

6|CONSIDERACIONS PER A LA PROVA GENÈTICA

És important tenir en compte que el tipus de prova que s'escull per a la prova genètica en un pacient pot tenir un gran impacte en la possibilitat de trobar una causa genètica. Els avenços tecnològics en els enfocaments de proves genètiques han fet possible les proves CNV (basades en MPS) i la seqüenciació basada en exoma i els avantatges es reconeixen amb el pas dels anys (figura suplementària 2). La composició del panell genètic, el nombre de gens provats i l'anàlisi de CNV poden influir en la probabilitat de trobar una causa genètica. A més, en casos de sospita d'ADTKD, és important tenir en compte les proves MUC1 o proves addicionals de PKD1 en casos sospitosos d'ADPKD després de les proves de panells multigènics o d'exoma basades en MPS. En només 6 estudis (incloent-hi 3/4 cohorts ADTKD) es van realitzar proves addicionals per detectar una inserció de citosina a la regió de repeticions en tàndem de nombre variable de MUC1 que MPS sol passar a faltar (Taula suplementària 3) (Kirby et al., 2013). Dinou estudis van informar de proves addicionals per assolir una cobertura suficient de tots els exons PKD1, cosa que és un repte a causa de l'existència de sis pseudogens (PKD1P1-6) amb un 97,7% d'identitat de seqüència. Quinze d'aquests estudis es van centrar en fenotips de ciliopatia i quatre van incloure fenotips de malaltia renal mixta. Un estudi va informar de l'exclusió de pacients amb ADPKD perquè PKD1 no està ben capturat per WES (Lata et al., 2018). Els metges que demanen proves genètiques han de ser conscients de quines variants que causen malalties en quins gens es poden detectar mitjançant quina prova genètica i quan s'han de demanar proves genètiques addicionals (Knoers et al., 2022; Köttgen et al., 2022).

De vegades, els metges que encara no tenen experiència en genètica (nefrona) semblen assumir que "realitzar WES" cobrirà qualsevol variant que causen malalties. Un aspecte d'aquesta falsa suposició és la detecció de CNV. Tot i que l'anàlisi de CNV basada en WES està disponible, encara no sempre s'inclou. Per tant, és bo considerar si, per a un pacient específic, cal fer proves addicionals de CNV. En els estudis inclosos en aquesta revisió, es van utilitzar moltes eines diferents, amb diferències en el rendiment per eina que es van informar (Moreno-Cabrera et al., 2020; Yao et al., 2017). Alguns estudis van incloure els CNV en tots els gens, mentre que altres es van centrar només en els gens dins d'un panell de gens (figura suplementària 3). A més, es van realitzar proves separades (per exemple, MLPA que cobreix un gen o una matriu SNP a tot el genoma) per a la detecció de CNV. Altres aspectes d'aquesta falsa suposició són variacions en la cobertura gènica, regions difícils de seqüenciar (per exemple, regions repetides, pseudogens) i variants no codificants.

En el passat, els panells de gens sempre es basaven en l'enriquiment, el que significa que només es seqüenciarien i analitzaven el conjunt de gens que es seleccionaven abans de la seqüenciació. Avui, els laboratoris de diagnòstic sovint utilitzen panells de gens basats en exoma (figura suplementària 2b). Amb aquest enfocament, es seqüencia l'exoma complet, però només s'analitzen els gens d'interès d'un panell de gens específics. Un avantatge de WES i l'ús de panells de gens basats en exoma és el mètode eficient en què es deriven dades, inclosa la possibilitat d'analitzar gens addicionals sense haver de reseqüenciar l'ADN del pacient (Knoers et al., 2022). WES també permet reanalitzar o identificar fenocòpies. Els estudis inclosos en aquesta revisió ho posen de manifest. Warejko et al. van identificar fenocòpies en un 4% dels pacients d'una cohort de SRNS (Warejko et al., 2018). També a la cohort NS de Landini et al., el fenotipat invers dels pacients permet el diagnòstic de fenocòpies en el 28% dels casos (Landini et al., 2020). Szab o et al. van trobar fenocòpies en el 22% dels pacients amb ARPKD (Szab o et al., 2018). En una cohort amb diversos fenotips, Riedhammer et al. va descobrir que el 19% dels casos diagnosticats eren una fenocòpia (Riedhammer et al., 2020). Les fenocòpies i les diferències locals en el fenotipat clínic són arguments per a una composició de panell genètic més àmplia. Les proves genètiques àmplies també tenen reptes importants, com ara una major probabilitat de troballes incidentals i les dificultats en la interpretació de variants de significat desconegut (VUS) (Bertier, Hétu i Joly, 2016). Això s'ha de tenir en compte a l'hora de triar un panell de gens més petit inicial o un panell multigènic ampli o una anàlisi de l'exoma. A més, els assessors haurien de sentir-se còmodes i hàbils per assessorar aquestes troballes i quan referir-se a un genetista clínic. La disponibilitat de diferents proves genètiques, l'atenció genètica i l'acord sobre quina prova poden sol·licitar els no genetistes variaran segons el país.

En tots els fenotips descrits en aquesta revisió, només un nombre limitat de gens són responsables del 50% superior dels diagnòstics establerts, posant de manifest la rellevància dels gens bàsics per als fenotips (Martin et al., 2019). Tot i que només un nombre limitat de gens són responsables del 50% superior dels diagnòstics genètics, l'estudi de Groopman et al. va trobar que només es van detectar 39/66 trastorns monogènics detectats en un sol pacient (Groopman et al., 2019). En aquest mateix estudi, quatre gens van ser responsables del 54% dels diagnòstics confirmats. Rao et al. va informar que 15 gens representaven el 61% dels diagnòstics genètics, però en total es van detectar 106 trastorns monogènics diferents en una cohort de 1.001 pacients pediàtrics amb sospita clínica de malaltia renal genètica (Rao et al., 2019). Per tant, recomanem considerar l'anàlisi d'un conjunt complet de conegutsmalaltia de ronyógens després d'un primer panell basat en l'exoma enfocat negatiu, també a la llum de la possibilitat de fenocòpies. Recomanem no començar amb aquest gran conjunt de gens per evitar variants innecessàries de significat desconegut i troballes incidentals. Aquesta recomanació depèn de nou de la disponibilitat i els costos de la reanàlisi per país. Tot i que aquesta revisió se centra principalment en el rendiment diagnòstic a través i dinsgrups fenotips renals, consideracions addicionals de proves genètiques perpacients amb malaltia renales pot trobar a les recomanacions publicades recentment (Knoers et al., 2022; Köttgen et al., 2022).

7|PUNTS FORTS I LIMITACIONS

El nostre enfocament sistemàtic de la selecció i l'extracció de dades va donar lloc a la visió general més àmplia del rendiment diagnòstic en nefrogènesi. Tenint en compte els reptes de comparar els diferents estudis, només vam resumir i visualitzar les dades, però no vam realitzar una metaanàlisi estadística. Una variable important va ser la classificació de variants que no era idèntica en tots els estudis. En 59/115 articles només es van utilitzar els criteris de l'American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) i en 4/115 es van utilitzar criteris ACMG juntament amb altres passos de filtratge (taula suplementària 3). Alguns estudis que van utilitzar altres classificacions de variants diferents dels criteris ACMG van utilitzar les mateixes descripcions de variants (és a dir, variants patògenes i probables patògenes) tal com es mostra a la taula dinàmica de la taula suplementària 3. Vam trobar que els articles publicats més recentment utilitzaven criteris ACMG (complementaris). Figura 2d). Benson et al. destaca l'impacte que poden tenir diferents criteris de classificació en el rendiment informat en informar d'un rendiment diagnòstic del 68% mitjançant els criteris ACMG i un rendiment del 81% mitjançant les directrius de patogenicitat de Mayo Clinic. A més, no sempre es va informar si es van incloure variants patògenes i patògenes probables. En alguns casos, els VUS es van incloure en el rendiment diagnòstic informat i no va ser possible restar-los, cosa que podria donar un rendiment injustament elevat. Amb els panells basats en WES i els criteris ACMG que s'utilitzen amb més freqüència, pot ser més fàcil comparar estudis futurs. Vam optar per incloure estudis publicats en els darrers 10 anys, però fins i tot amb aquesta limitació, esperem que el rendiment diagnòstic probablement fos més gran en els articles més recents a causa d'un augment del nombre de gens coneguts de malaltia renal i de noves tècniques. Tot i que les nostres dades no donen suport clarament a aquesta noció (dades no mostrades), això probablement s'explica per altres factors que emmascaren aquest efecte. Els informes futurs sobre el rendiment del diagnòstic també es beneficiaran dels informes de la població de la qual prové la població d'estudi. Això no sempre es va informar als articles inclosos en aquesta revisió, la qual cosa va fer que la interpretació del rendiment mínim diagnòstic en aquestes cohorts (clíniques) fos difícil.

8|QUÈ ÉS A continuació?

Tot i que aquesta revisió ofereix una àmplia visió general del rendiment diagnòstic informat, encara hi ha llacunes en el coneixement sobre la veritable prevalença demalaltia renal hereditàriaen la població general d'ERC. Per obtenir una estimació d'això, caldria establir un estudi en què tots els pacients amb malaltia renal vist en diferents entorns clínics rebin proves genètiques. Com que això podria no ser factible, ens agradaria que fos almenys una crida a l'acció per informar detalladament sobre la població informada en estudis de rendiment diagnòstic, informar sobre les característiques del pacient, la cohort i la prova esmentades en aquesta revisió i utilitzar protocols estàndard de classificació de variants. A més, no s'han de perdre oportunitats per a la segregació de variants (d'importància desconeguda) i l'anàlisi de CNV. Una altra oportunitat per diagnosticar pacients addicionals és WGS, que permet seqüenciar tot el genoma. Per determinar, en última instància, el veritable rendiment diagnòstic, encara hi ha un llarg camí per endavant, ja que és probable que encara hi hagi moltes causes genètiques codificants i no codificants implicades enmalaltia de ronyóque cal descobrir.

9|CONCLUSIÓ

Aquesta revisió ofereix una visió general del rendiment diagnòstic de les proves genètiques a través i dinsfenotips de la malaltia renal. Les troballes més importants i els missatges clau per portar a casa es resumeixen a la figura 6. Confirmem que les característiques del pacient (p. ex., antecedents familiars, consanguinitat, característiques extrarenals i edat d'inici jove) poden afectar positivament el rendiment diagnòstic. A més, destaquem l'impacte de la prova genètica específica sol·licitada, inclosa la seva capacitat per revelar CNV. També mostrem la importància de considerar el tipus de cohort en què es va realitzar un estudi, per interpretar el rendiment informat. Mostrem que un diagnòstic genètic pot tenir un impacte diagnòstic, terapèutic i pronòstic. Tenint en compte les reclassificacions basades en les troballes genètiques i la possibilitat d'evitar la necessitat d'una biòpsia renal diagnòstica en molts casos, es pot considerar un enfocament genètic primer en la pràctica clínica per establir el diagnòstic del pacient. El nombre de gens a examinar, si i com s'han de realitzar anàlisis de CNV i, en ADTKD/ADPKD, proves addicionals per cobrir MUC1 i PKD1 s'han de sospesar quan es sol·licita una prova genètica. Per descomptat, és important tenir en compte que les situacions específiques del pacient i de la família també poden influir en la decisió de fer una prova genètica, i també quina prova genètica es tria. A més, la disponibilitat de proves genètiques en diferents països pot tenir un impacte en l'accessibilitat de les proves genètiques. Aquesta revisió ofereix als metges orientació per estimar una probabilitat a priori de trobar una causa genètica per a la malaltia renal en els seus pacients.

APORTACIONS DE L'AUTOR

Rozemarijn Snoek, Laura R. Claus i Albertien M. van Eerde van crear el disseny de la revisió. Nou VAM Knoers van proporcionar comentaris estructurals sobre el disseny i el progrés de l'estudi. Rozemarijn Snoek va extreure dades d'un subconjunt d'articles per definir les variables d'interès. Laura R. Claus va extreure, avaluar i analitzar les dades i redactar el treball. Albertien M. van Eerde i Nine VAM Knoers van valorar críticament el document. Tots els autors van aprovar la versió final del manuscrit. AGRAÏMENTS Els autors agraeixen i donen les gràcies a Rieko Haring i Richard van Kemenade que van fer cerques a la base de dades de literatura i van examinar els articles per ser elegibles com a part de la seva tesi de grau. Aquest treball va comptar amb el suport dels holandesosFundació del ronyó(18OKG19 a AM v. E.). Els autors d'aquesta publicació són membres de la Xarxa Europea de Referència per a Malalties Renals Rares (ERKNet). CONFLICTE D'INTERESSOS Els autors declaren no conflicte d'interessos.

DECLARACIÓ DE DISPONIBILITAT DE DADES L'intercanvi de dades no és aplicable a aquest article, ja que no s'han creat ni analitzat dades noves en aquest estudi.

REFERÈNCIES

Adalat, S., Hayes, WN, Bryant, WA, Booth, J., Woolf, AS, Kleta, R.,… Bockenhauer, D. (2019). Les mutacions HNF1B estan associades amb un Gitelman‐com la tubulopatia que es desenvolupa durant la infància.Informes internacionals del ronyó, 4, 1304–1311. Ahn, YH, Lee, C., Kim, NKD, Park, E., Kang, HG, Ha, IS,… Cheong, HI (2020).

La seqüenciació de l'exoma dirigida va proporcionar un diagnòstic genètic complet de les anomalies congènites del ronyó i el tracte urinari.Revista de Medicina Clínica, 9. Al Alawi, I., Al Salmi, I., Al Rahbi, F., Al Riyami, M., Al Kalbani, N., Al Ghaithi, B.,… Sayer, JA (2019).

Diagnòstic genètic molecular de pacients d'Oman amb malaltia renal quística hereditària.Informes internacionals del ronyó, 4, 1751–1759. Al Alawi, I., Molinari, E., Al Salmi, I., Al Rahbi, F., Al Mawali, A. i Sayer, JA (2020). Característiques clíniques i genètiques de la malaltia renal poliquística autosòmica recessiva a Oman.Nefrologia BMC, 21, 1–11. AL‐Hamed, MH, Al‐Sabban, E., Al‐Mojalli, H., Al‐Harbi, N., Faqeih, E., Al Shaya, H.,… Meyer, BF (2013)Una anàlisi genètica molecular de la síndrome nefròtica infantil en una cohort de famílies de l'Aràbia Saudita. Revista de genètica humana, 58, 480–489. Al‐Hamed, MH, Kurdi, W., Alsahan, N., Alabdullah, Z., Abudraz, R., Tulbah, M., … Albaqumi, M. (2016). L'espectre genètic de pacients de l'Aràbia Saudita amb malaltia renal quística prenatal i fenotips de ciliopatia mitjançant un panell de gens renals dirigit. Revista de genètica mèdica, 53, 338–347.

Servei de suport:

Correu electrònic:wallence.suen@wecistanche.com

WhatsApp/Tel:+86 15292862950}

Botiga:

https://www.xjcistanche.com/cistanche-shop