SARS-CoV-2 Infecció i efectivitat de la vacuna a Anglaterra (REACT-1): una sèrie d'enquestes transversals aleatòries a la comunitat

Contacte: Audrey Hu Whatsapp/hp: 0086 13880143964 Correu electrònic:audrey.hu@wecistanche.com

Marc Chateau-Hyam, Haowei Wang*, Oliver Eales*, David Haw*, Barbara Bodinier*, Matthew Whitaker, Caroline E Walters, Kylie EC Ainslie, Christina Atchison, Claudio Fronterre, Peter J Diggle, Andrew J Page, Alexander J Trotter, Deborah Ashby, Wendy Barclay, Graham Taylor, Graham Cooke, Helen Ward, Ara Darzi, Steven Riley, Christl A Donnelly†, Paul Elliott†, en col·laboració amb el consorci COVID-19 Genomics UK

Resum

Antecedents: Anglaterra ha viscut una tercera onada de l'epidèmia de COVID{{0}} des de finals del 2 de maig{{40}}21, coincidint amb la ràpida propagació del delta (B. 1.617.2), malgrat els alts nivells de vacunació entre adults. Les taxes de vacunació (dosi única) a Anglaterra són més baixes entre els nens de 16 a 17 anys i de 12 a 15 anys, la vacunació dels quals a Anglaterra va començar l'agost i el 2 de setembre021, respectivament. El nostre objectiu és analitzar les dinàmiques subjacents que impulsen els patrons de la prevalença del SARS-CoV-2 durant el 2021 de setembre a Anglaterra. Mètodes: l'estudi d'avaluació en temps real de la transmissió comunitària-1 (REACT-1), que va començar la recollida de dades el 2 de maig02{{10{{128} }}}, implica una sèrie d'enquestes transversals aleatòries a la població general d'Anglaterra de 5 anys o més. Utilitzant les dades de positivitat dels hisopos de RT-PCR de {{20}} participants amb hisopos de gola i nas vàlids a la ronda 14 de REACT-1 (del 9 al 27 de setembre, 2021), hem estimat la prevalença comunitària del SARS-CoV-2 i l'eficàcia de la vacuna contra la infecció combinant les dades de la ronda 14 amb les de la ronda 13 (del 24 de juny al 12 de juliol del 2021; n{{34} }). Resultats: durant el 2 de setembre021, vam estimar una taxa mitjana de positivitat per RT-PCR de 0·83% (95% CrI 0·76–0·89), amb un nombre de reproducció (R) global d'1.03 (95% CrI 0.94–1.14). Entre els 475 (62,2 per cent) dels 764 hisops positius seqüenciats, tots eren de la variant delta; 22 (4.63 per cent; 95 per cent CI 3.07–6.91) van incloure la mutació Tyr145His a la proteïna espiga associada amb el sublinatge AY.4, i hi va haver una mutació Glu484Lys. L'edat, la regió, l'estatus clau del treballador i la mida de la llar van contribuir conjuntament al risc de positivitat del hisop. La prevalença ponderada més alta es va observar entre els nens de 5 a 12 anys, al 2,32% (95% CrI 1,96–2,73) i els de 13 a 17 anys, al 2,55% (2,11–3). ·08). L'epidèmia de SARS-CoV-2 va créixer entre els 5-11 anys, amb un R d'1·42 (95% CrI 1·18–1·68), però va disminuir en els de 18 a 54 anys, amb una R de 0·81 (0·68–0·97). A les edats, de 18 a 64 anys, l'eficàcia ajustada de la vacuna contra la infecció va ser del 62,8% (IC del 95% 49,3–72,7) després de dues dosis en comparació amb les persones no vacunades, per a totes les vacunes combinades, el 44,8% (22). ·5–60·7) per a la vacuna ChAdOx1 n Cov-19 (Oxford–AstraZeneca) i el 71,3 per cent (56,6–81,0) per a la vacuna BNT162b2 (Pfizer–BioNTech). En individus de 18 anys o més, la prevalença ponderada de la positivitat de l'hisop va ser del 0,35% (95% CrI 0,31–0,40) si la segona dosi es va administrar fins a 3 mesos abans del seu hisop, però del 0,55%. 0.50–0.61) per a aquells que van rebre la seva segona dosi 3-6 mesos abans del seu hisop, en comparació amb l'1.76 per cent (1.60-1.95) entre els individus no vacunats.Interpretació:El setembre de 2021, a l'inici del trimestre escolar de tardor a Anglaterra, les infeccions augmentaven exponencialment en nens de 5 a 17 anys, en un moment en què les taxes de vacunació eren baixes en aquest grup d'edat. En adults, en comparació amb els que van rebre la seva segona dosi fa menys de 3 mesos, la prevalença més alta de positivitat amb hisop entre els 3 i els 6 mesos després de dues dosis de la vacuna COVID-19 suggereix un major risc d'infeccions avançades durant aquest període. . El programa de vacunació ha d'arribar als nens, així com als adults no vacunats i parcialment vacunats per reduir la transmissió del SARS-CoV-2 i les interrupcions associades a la feina i l'educació. Finançament Departament de Salut i Atenció Social, Anglaterra.

Beneficis per a la salut del cistanche: millora la immunitat

Introducció

El Regne Unit ha experimentat una de les taxes d'infecció per SARS-CoV-2 i mortalitat per COVID{-19 més altes d'Europa des de l'inici de la pandèmia. No obstant això, el Regne Unit també va ser un dels primers països a implementar un programa nacional de vacunació, a partir del desembre de 2020, amb un llançament a la població dirigit inicialment a les persones amb més risc, incloses les persones grans (començant per les persones de més de 80 anys o iguals). anys), treballadors sanitaris i socials, i persones amb condicions de salut especificades.1

La ràpida propagació de la variant delta (B.1.617.2) a Anglaterra a partir del maig de 2021, va coincidir amb la tercera onada d'infeccions2, i la prevalença d'infeccions es va mantenir alta durant l'estiu i més enllà. Durant l'agost de 2021, la incidència de casos confirmats per RT-PCR d'infecció per SARS-CoV-2 presentats al programa nacional de proves a Anglaterra (Pilar 2) va augmentar gradualment més d'un 10% en general.

El setembre de 2021, es va ampliar el desplegament del programa nacional de vacunació contra la COVID-19 a Anglaterra per oferir una (tercera) dosi de reforç, almenys 6 mesos després de la segona dosi, als treballadors sanitaris i d'atenció social, totes les persones grans. de més de 50 anys i persones més joves en risc. Aquesta extensió també incloïa la vacunació dels nens més grans en edat escolar (més o igual a 12 anys), als quals inicialment se'ls va oferir una única dosi de vacuna a tot el Regne Unit. Tanmateix, a mitjans de setembre de 2021, el nombre de persones que rebien les primeres dosis de vacunació va baixar al seu nivell més baix (poc menys de 21.000 dosis diàries de mitjana al Regne Unit) des d'almenys mitjans de gener de 2021 (les primeres dades disponibles públicament) . No obstant això, a partir del 26 de setembre de 2021, gairebé el 90 per cent de les persones de 18 anys o més a Anglaterra havien rebut la seva primera dosi, més del 83 per cent havien rebut la seva segona dosi i el 13 per cent havien rebut una tercera dosi de vacuna. Entre els nens d'entre 12 i 17 anys, el 8,9% havia rebut una sola dosi. Aproximadament el 53 per cent dels adults es va vacunar amb la vacuna ChAdOx1 nCov-19 (Oxford–AstraZeneca) i el 47 per cent amb la vacuna BNT162b2 (Pfizer–BioNTech) o la vacuna mRNA-1273 (Moderna);3 tots els nens vacunats de 12 a 17 anys van rebre una dosi de la vacuna BNT162b2 (Pfizer–BioNTech) o ARNm-1273 (Moderna).

A principis de setembre de 2021, els nens d'entre 5 i 17 anys a Anglaterra van tornar a l'escola, i el Departament d'Educació ja no va recomanar que fos necessari mantenir els nens en grups inconsistents (anomenats bombolles socials). A més, ja no s'esperava que les escoles fessin el rastreig de contactes, amb contactes propers a les escoles ara identificats pel programa nacional de rastreig de contactes (el servei de proves i seguiment del Servei Nacional de Salut [NHS] del Regne Unit).4 Durant aquest primer mes de retorn dels nens a l'escola , la incidència de casos confirmats de SARS-CoV-2 a Anglaterra registrats a través del pilar 2 va baixar a un mínim a mitjans de setembre de 2021 i després va tornar a augmentar, però en general va ser relativament estable. Això contrasta molt amb la situació a Escòcia, on la incidència dels casos confirmats de SARS-CoV-2 va augmentar més d'un 450 per cent durant l'agost, en un moment en què els nens en edat escolar (de 5 a 17 anys) en Escòcia va tornar a l'escola.5 Aquestes tendències a nivell nacional (i més locals) depenen molt del context, inclosa la prevalença local i la dinàmica de transmissió de la variant delta, el retorn a l'escola, els canvis en els patrons de barreja social, el treball a casa i l'oficina. , i nivells d'immunitat induïda per la vacuna i adquirida de manera natural.

Aquí, descrivim els patrons de conducció de la dinàmica subjacent en la prevalença del SARS-CoV-2 durant el setembre de 2021, a Anglaterra, mitjançant l'anàlisi de la positivitat de l'escotill RT-PCR de la catorzena ronda de recollida de dades de l'avaluació en temps real de la transmissió comunitària{{ 5}} Estudi (REACT-1).6,7 En aquesta ronda, es van obtenir hisopos de gola i nas d'una mostra aleatòria de la població d'Anglaterra del 9 al 27 de setembre de 2021. També vam combinar les dades de la ronda 14. amb dades de la ronda 13, en què es van obtenir hisops del 24 de juny al 12 de juliol de 2021.

extracte de cistanche en pols

Mètodes

Estudi de població

Els mètodes d'estudi REACT-1 s'han informat en altres llocs.7 Breument: amb la recollida de dades a partir de l'1 de maig de 2020, vam convidar a l'estudi mostres transversals aleatòries de la població a Anglaterra (edat superior o igual a 5 anys). ). Les dades es van obtenir mensualment durant un període de 2 a 3 setmanes, excepte el desembre de 2020 i l'agost de 2021, quan no es va fer cap enquesta. A cada ronda de recollida de dades, es va convidar a participar en l'estudi a persones amb nom de la llista NHS de pacients registrats amb un metge general a Anglaterra, a partir de llistes obtingudes de NHS Digital.

Des de l'1 de maig de 2020 (inici de la ronda 1) fins al 3 de maig de 2021 (final de la ronda 11), vam tenir com a objectiu un nombre aproximadament igual de participants a cadascuna de les 315 autoritats locals de nivell inferior a Anglaterra (combinant les illes Scilly). amb Cornualla i la ciutat de Londres amb Westminster), però a partir de la ronda 12 (del 20 de maig al 7 de juny de 2021) vam modificar el procediment de mostreig per obtenir una mostra aleatòria en proporció a la població a nivell d'autoritat local de nivell inferior. Això va augmentar el mostreig a les zones de la ciutat amb una densitat de població més alta, tot i que els informes de prevalença no es van veure afectats, ja que vam ponderar les dades a cada ronda per ser representatives del conjunt d'Anglaterra (que es descriu a continuació).

Proves de RT-PCR i dades de vacunació

Els participants van proporcionar un hisop de gola i nas autoadministrat (o un pare o tutor va obtenir un hisop per a nens de 5 a 12 anys) seguint instruccions escrites i de vídeo. Els hisops es van enviar a un laboratori central per a l'anàlisi mitjançant RT-PCR. L'àcid nucleic extret es va analitzar per a la presència o absència de SARS-CoV-2 amb el kit ViroBOAR 1·0 RT-qPCR (Eurofins Genomics, GmbH, Ebersberg, Alemanya) per a SARS-CoV{{10 }} al Roche Lightcycler 480 II per detectar en paral·lel dos gens diana: el gen N i el gen E. L'assaig té una especificitat propera al 100 per cent i un límit de detecció de deu còpies per microlitre. Les mostres es van considerar positives si es van detectar els dos gens diana (el gen N i el gen E) o si el gen N es va detectar amb un valor de llindar de cicle (Ct) inferior a 37.

Per a la ronda 14, vam modificar la forma en què es van manipular les mostres de hisop. Des de la ronda 1 (a partir de l'1 de maig de 2020) fins a la ronda 13 (que finalitza el 12 de juliol de 2021) vam utilitzar hisops secs enviats refrigerats al laboratori per missatgeria per fer proves de RT-PCR. A la ronda 14, vam canviar a hisops humits en solució salina, que després es van assignar aleatòriament en una base 1:1 per enviar-los per missatgeria (n=46 705 hisops vàlids retornats) o per correu (n{{12} }).

Com a part de l'estudi REACT-1, vam obtenir dades sobre edat, sexe, adreça i codi postal residencial del registre de l'NHS, amb més informació sobre dades demogràfiques, salut (inclòs l'estat de vacunació autoinformat) i estil de vida derivat de un qüestionari en línia o per telèfon. Es va demanar als participants el consentiment per vincular-los als seus registres de l'NHS, incloses les dades del programa d'immunització COVID-19. L'estat de vacunació a partir de l'enllaç de dades es va derivar amb el supòsit que una dosi només seria efectiva a partir de 14 dies o més després de la injecció. Per tant, les persones no vacunades es van definir com aquelles que no havien rebut cap dosi de vacuna o havien rebut una dosi menys de 14 dies abans de la neteja; Les persones vacunades amb una dosi única es van definir com aquelles que van rebre una dosi 14 dies o més abans de l'evacuació i sense una segona dosi o una segona dosi menys de 14 dies abans de l'evacuació, i les persones que havien rebut dues dosis de vacuna es van definir com les que havien rebut la seva segona dosi 14 dies o més abans de la neteja.

Seqüenciació del genoma viral

Després de les proves RT-PCR, es van congelar mostres positives amb valors Ct del gen N inferiors a 34 i amb material suficient i enviades per a la seqüenciació del genoma viral al Quadram Institute, Norwich, Regne Unit. El protocol de seqüenciació ARTIC SARS-CoV-28 es va utilitzar per a l'amplificació de l'ARN viral i la plataforma CoronaHiT es va utilitzar per a la preparació de biblioteques de seqüenciació.9 Es va utilitzar el pipeline bioinformàtic ARTIC10 per a l'anàlisi de dades de seqüenciació i es van assignar llinatges. amb PangoLEARN.11

Anàlisis estadístics

Les anàlisis estadístiques es van fer amb el programari R (versió R 4.0.5 (31/03/2021, Shake and Throw). Hem calculat la prevalença no ponderada del SARS-CoV-2 per sociodemogràfica, ocupacional i altres grups dividint els recomptes de la positivitat de l'hisop (a partir de la RT-PCR) pel nombre de hisopos vàlids retornats. Hem utilitzat la ponderació de la vora12 per obtenir la prevalença ponderada per ser representativa de la població d'Anglaterra en el seu conjunt.

Hem utilitzat un model exponencial de creixement o decadència per analitzar les tendències de la positivitat del hisop al llarg del temps. Vam suposar que el nombre de mostres positives (del nombre total de mostres) cada dia va sorgir d'una distribució binomial basada en el dia de la neteja o, si no està disponible, el dia de la recollida de la mostra (mensatge) o la primera exploració de la mostra per part del Correus, si s'envia per correu. Hem estimat els intervals creïbles posteriors (CrIs) utilitzant un mostreig sense volta en U bivariant assumint distribucions prèvies uniformes sobre la probabilitat de positivitat del hisop el dia zero i la taxa de creixement.13 Hem estimat el nombre de reproducció (R) assumint que el temps de generació estava distribuït gamma. amb el paràmetre de forma n=2·29 i el paràmetre de velocitat =0·36 (corresponent a un temps mitjà de generació de 6·29 dies).14

Ajustem un model bayesià de spline penalitzat (P-spline)16 a les dades diàries utilitzant dades de totes les rondes de REACT-1. L'estimació de la prevalença diària de la positivitat del hisop va utilitzar un mostrador sense gir a l'espai logit, amb les dades segmentades en seccions aproximadament de 5-dia per nusos espaiats regularment (proporcionant un equilibri adequat entre la resolució temporal i la viabilitat computacional), i més nusos inclosos més enllà del període d'estudi per minimitzar els efectes de vora. També vam ajustar les P-splines a les dades REACT-1 estratificades per edat com l'anterior, en què es va ajustar una P-spline per separat a cada grup d'edat, però es va suposar que el paràmetre de suavització, ρ, era el millor valor d'ajust obtingut. perquè el model s'ajusti a totes les dades. Per a més claredat, tot i que les estimacions es basen en el conjunt de dades REACT-1 complet, aquí només informem les estimacions dels dies de recollida de la ronda 14.

Hem estimat l'efectivitat de la vacuna contra la infecció per SARS-CoV-2 combinant les dades de les rondes 13 i 14 per augmentar el poder estadístic. Es va estimar l'eficàcia de la vacuna com a proporció de probabilitats (OR) d'1, on l'OR es va obtenir a partir d'un model de regressió logística del risc de positivitat de l'hisop en els dos vacunats (és a dir, aquells amb dues dosis, amb la segona dosi administrada més de 14 dies). abans de fer hisopos) i individus no vacunats, amb ajust per ronda, després addicionalment per edat i sexe, i un ajust addicional per a un índex de quintil de privació múltiple i ètnia. Hem obtingut l'aprovació d'ètica de la recerca del Comitè d'ètica de la recerca de South Central-Berkshire B (ID del sistema d'aplicació de recerca integrat [IRAS]: 283787).

Beneficis de l'extracte de cistanche

Resultats

De 822176 persones convidades a participar a la ronda 14, 147393 (17,9 per cent ) es van registrar i 100527 (12,2 per cent ) van proporcionar un hisop amb un resultat RT-PCR vàlid, i 87966 (87,5 per cent) van consentir l'enllaç de dades . A la ronda 13 es van convidar 841227 participants; 147332 registrats i 98233 (66,7 per cent) d'ells van proporcionar un hisop amb un resultat de RT-PCR vàlid. L'agrupació de dades enllaçades d'ambdues rondes va donar lloc a 172.862 participants, inclosos 102.142 (49.923 a la ronda 13 i 52.219 a la ronda 14) d'entre 18 i 64 anys que es van incloure a les nostres anàlisis d'efectivitat de la vacuna (apèndix p. 7). Una descripció de les característiques dels participants de REACT-1 de la ronda 13 i la ronda 14 va mostrar que els que acceptaven l'enllaç de dades tenien més probabilitats de ser homes, de 45 anys o més, que no visquessin a Londres, White, d'un solter. persona de la llar i haver experimentat símptomes relacionats amb la COVID{33}. La majoria d'aquestes diferències eren relativament petites (apèndix p 2). La prevalença va ser lleugerament superior i els valors de Ct per a mostres positives lleugerament inferiors en els hisops recollits per missatgeria que en els enviats per correu (annex pp 3, 8).

Dels 100527 hisopos vàlids de la ronda 14, 764 van ser positius, donant una prevalença de 0·83% (95% CrI 0·76–{{ 57}}·89) ponderat per ser representatiu de la població d'Anglaterra (apèndix pàg. 4). La prevalença ponderada més alta durant el 2021 de setembre es va observar en adolescents de 13 a 17 anys, en un 2,55% (95% CrI 2·11–3·{08) i en nens. de 5 a 12 anys, al 2,32 per cent (1,96–2,73; taula 1, annex pàg 9). La P-spline de la ronda 14, ajustada a les dades de totes les rondes REACT-1, va ser indicativa d'una tendència estable o creixent en la prevalença de la positivitat del hisop (figura 1A), amb R estimada en 1·{{68} }3 (95% CrI 0·94–1·14) en totes les edats combinades (taula 2). Les P-splines ajustades van indicar una prevalença creixent entre els 5 i els 11 anys i una prevalença decreixent entre els 18 i els 54 anys (figura 1B), amb una probabilitat posterior superior al 99 per cent que la taxa de creixement diferís entre aquests dos grups. L'R corresponent era 1·42 (95% CrI 1·18–1·68), amb una probabilitat posterior superior a 0·99 que R fos superior a 1 als 5-11 anys; R era 0·95 (0·76–1·16), amb una probabilitat posterior de 0·32 que R fos superior a 1 en els de 12 a 17 anys; i R era de 0.81 (0.68–0.97), amb una probabilitat posterior de 0.01 que R fos superior a 1 en els de 18 a 54 anys (taula 2).

Weighted prevalence also varied by region (table 1; appendix p 9), ranging from 0·57% (95% CrI 0·45–0·72) in the South East to 1·25% (1·00–1·57) in Yorkshire and The Humber. Within round 14, there was evidence of epidemic growth (with a posterior probability greater than 0·99 that R>1) a Londres, amb un R d'1·59 (95% CrI 1·23–1·99), i a les Midlands orientals, amb un R d'1·36 (1·05–1·73; taula 2) .

Vam trobar una prevalença ponderada més alta de la positivitat del hisop entre els participants d'ètnia negra, a l'1,41% (95% CrI 0·91–2·19), en comparació amb la dels participants blancs, a 0 ·78 per cent (0·72–0·85; taula 1). Els participants que vivien en llars més nombroses tenien una prevalença ponderada més alta que els de les llars més petites, que oscil·lava entre el 0·33% (95% CrI 0··25-0·44) per a una sola persona llars a l'1,75 per cent (1,24–2,46) per a les llars amb sis o més persones (taula 1). La prevalença també va ser més alta a les llars amb un o més fills, amb un 1.37% (95% CrI 1.22–1.52), en comparació amb el 0·4{0 per cent ({{4{ {49}}}}·35–0·46) per a llars sense fills; i la prevalença ponderada va ser del 7,35 per cent (6,50–8,31) entre els que van informar estar en contacte amb un cas confirmat de COVID{-19, en comparació amb el 0,43 per cent (0,38) –0·49) entre els que no tenen aquest contacte (taula 1).

Utilitzant l'estat de vacunació autoinformat, vam trobar una prevalença més alta en participants no vacunats (totes les edats), a l'1.73 per cent (95 per cent CrI 1.42–2.12), en comparació amb els que van informar dues dosis de vacuna, a {{8. }}·56 per cent ({{10}}·50–0·62; taula 1).

En l'anàlisi de regressió logística multivariable, els treballadors clau, diferents dels sanitaris i de les llars d'atenció, tenien un risc més gran de positivitat amb hisop en comparació amb altres treballadors (OR 1·35 [IC del 95% 1·10–1·66]; taula 3) . La positivitat del hisop també va ser més alta amb l'augment de la mida de la llar (OR ajustat mútuament 1.77 [IC del 95 per cent 1.44–2.17] per a llars de tres a cinc persones i 2.37 [1.62–3.47] per a llars de sis o més persones), en comparació amb les llars amb una o dues persones.

Hem agrupat les dades de la vacuna enllaçada de les rondes 13 i 14 (172862 participants en total, 19325 d'edat).<18 years,="" 102142="" aged="" 18–64="" years,="" and="" 51395="" aged="" ≥65="" years).="" because="" of="" the="" relatively="" small="" numbers="" of="" individuals="" vaccinated="" below="" the="" age="" of="" 18="" years,="" corresponding="" participants="" (n="19325)" were="" excluded="" from="" our="" vaccine="" effectiveness="" analyses.="" weighted="" prevalence="" was="" higher="" for="" those="" who="" received="" their="" second="" dose="" 3–6="" months="" before="" their="" swab="" than="" for="" those="" whose="" second="" dose="" was="" up="" to="" 3="" months="" before="" their="" swab="" (0·55%="" [95%="" cri="" 0·50–0·61]="" vs="" 0·35%="" [0·31–0·40];="" figure="" 2a;="" appendix="" p="" 5).="" the="" weighted="" prevalence="" for="" individuals="" whose="" second="" dose="" was="" administered="" more="" than="" 6="" months="" before="" their="" swab="" was="" similar="" to="" that="" of="" those="" vaccinated="" within="" 3–6="" months="" of="" their="" swab,="" at="" 0·52%="" (95%="" cri="" 0·33–0·78),="" but="" with="" a="" wider="" credible="" interval.="" the="" age="" distribution="" of="" participants="" by="" vaccination="" status="" indicated,="" as="" expected="" from="" the="" age-based="" rollout="" of="" the="" vaccine="" program="" in="" england,="" a="" higher="" proportion="" of="" individuals="" aged="" 35="" years="" and="" older="" among="" those="" who="" had="" received="" two="" vaccine="" doses="" compared="" to="" those="" who="" had="" received="" a="" single="" dose,="" or="" those="" who="" were="" unvaccinated="" (appendix="" p="" 5).="" nevertheless,="" among="" those="" who="" had="" received="" two="" vaccine="" doses,="" we="" observed="" similar="" age="" distributions="" in="" people="" who="" had="" received="" their="" second="" dose="" 3–6="" months="" or="" more="" than="" 6="" months="" before="" swabbing.="" regardless,="" in="" individuals="" aged="" 18="" years="" and="" older="" with="" linked="" data="" on="" vaccination="" status,="" the="" weighted="" prevalence="" in="" unvaccinated="" people,="" at="" 1·76%="" (95%="" cri="" 1·60–1·95),="" was="" three="" to="" five="" times="" higher="" than="" in="" double-vaccinated="" individuals,="" at="" 0·47%="" (0·43–0·51).="" reflecting="" the="" rollout="" of="" the="" vaccine="" program="" in="" england,="" a="" higher="" proportion="" of="" individuals="" who="" were="" unvaccinated="" or="" who="" had="" a="" single="" dose="" of="" the="" vaccine="" were="" younger="" (≤54="" years)="" than="" those="" with="" two="" doses="" (figure="" 2b;="" appendix="" p="" 5).="" however,="" in="" double-vaccinated="" participants,="" there="" was="" an="" apparent="" trend="" of="" increasing="" weighted="" prevalence="" in="" each="" age="" group="" for="" those="" who="" had="" received="" their="" second="" dose="" 3–6="" months="" before="" their="" swab="" compared="" to="" those="" who="" were="" vaccinated="" up="" to="" 3="" months="" before="" (figure="">

Les estimacions d'efectivitat de la vacuna es van derivar amb el conjunt de dades enllaçat per a les rondes 13 i 14 combinades només per a persones de 18 a 64 anys, ja que poques persones majors de 65 anys no estaven vacunades (1,1 per cent) i, com s'ha assenyalat, poques persones menors de 18 anys. anys es van vacunar (el 6,3 per cent en les rondes 13 i 14 juntes). Per a tots els individus d'entre 18 i 64 anys i totes les vacunes combinades, l'eficàcia de la vacuna contra la infecció va ser del 66,3% (IC del 95% 55,3–74,7), amb un ajustament per rodó, i del 62,8% (49,3–7). 72·7) en el model totalment ajustat. Les estimacions del punt d'eficàcia de la vacuna totalment ajustades per a les vacunes BNT162b2 (Pfizer–BioNTech) i mRNA-1273 (Moderna) eren comparables (71,3 per cent enfront del 75,1 per cent, amb un interval de confiança molt més ampli per a l'ARNm{{34). }} Vacuna [Moderna] a causa d'un nombre menor d'observacions), i superior a l'estimada per a la vacuna ChAdOx1 nCov-19 (Oxford– AstraZeneca) (44,8 per cent). Tanmateix, les diferències en les estimacions d'efectivitat de la vacuna per tipus de vacuna no van assolir una significació estadística a un nivell de significació 0·05. La inclusió d'un terme d'interacció per a vacuna per ronda no va suggerir que els efectes es modifiquessin a les rondes 13 i 14 (dades no mostrades). Les estimacions d'efectivitat de la vacuna en models restringits a casos simptomàtics eren similars a les dels models que també incloïen casos asimptomàtics (taula 4).

Els llinatges de les 475 mostres (62,2 per cent) seqüenciades entre els 764 hisops positius eren totes les variants delta o sublinatges del delta. AY.4 va ser el sublinatge més detectat, que representava el 61.5 per cent (95 per cent CI 57.0–65.7) de les mostres seqüenciades, i hi havia set mostres amb mutacions d'interès d'un sol punt tal com va definir Public. Health England (ara l'Agència de Seguretat Sanitària del Regne Unit): Glu484Lys, Asn501Tyr, Phe490Ser, Arg246Gly, Val483Phe, Pro251Leu i Gln613His (apèndix pàg. 6). Hem identificat 22 mostres (vuit amb el llinatge B.1.617.2 i 14 amb el llinatge AY.4) inclosa la mutació Tyr145His a la proteïna espiga, associada al sublinatge delta AY.4.2, corresponent al 4,63 per cent (IC del 95 per cent). 3·07–6·91) de tots els llinatges determinats.

millorar la immunitat cistanche càpsules

Discussió

En aquesta catorzena ronda de l'estudi REACT-1, vam trobar una prevalença elevada i creixent de la positivitat de l'hisop SARS-CoV-2 entre els nens en edat escolar a Anglaterra durant el setembre de 2021, cosa que reflecteix una major barreja social dels nens a mesura que van anar a l'escola durant el trimestre de tardor. Al mateix temps, vam trobar una prevalença decreixent entre els adults joves i de mitjana edat (18-54 anys). Aquesta observació podria reflectir l'efecte d'una infecció natural anterior, especialment entre els adults més joves en els quals les taxes d'infecció han estat altes,17 i el desplegament continuat del programa de vacunació a Anglaterra. A partir de l'abril de 2021, el programa nacional de vacunació contra la COVID{10}} es va ampliar per incloure adults menors de 50 anys18, una dosi única de vacuna per a adolescents més grans (de 16 a 17 anys) a partir de l'agost de 2021 i una dosi única per a nens d'edat. 12-15 anys a partir de mitjans de setembre de 2021.

A mitjans i finals de desembre de 2021, a tots els nens de 12 anys o més se'ls ofereix una segona dosi de vacuna i una tercera (de reforç) s'està distribuint a la població adulta de 18 anys o més. Com en el nostre informe anterior19 (ronda 13), vam trobar que tots els hisops seqüenciats eren de la variant delta i els seus sublinatges, cosa que indicava la substitució gairebé completa de l'alfa i altres variants per delta a Anglaterra en aquell moment. Vam detectar una possible mutació Glu484Lys d'escapament, que es tradueix en un estimat de 984 infeccions d'aquest tipus a Anglaterra amb un límit de confiança del 95 per cent inferior de 159. En total, hi va haver set mostres amb mutacions d'interès d'un sol punt, tal com va definir Public Health England. 22 mostres addicionals incloïen la mutació Tyr145His a la proteïna espiga associada al sublinatge AY.4.2.

La proporció corresponent d'AY.4 del 4.63 per cent (IC del 95 per cent 3.07–6.91) en tots els llinatges està en línia amb el 6 per cent de casos reportats per Public Health England la setmana que comença el 27 de setembre de 2021.20 La vacunació ha ha demostrat ser molt eficaç contra les complicacions greus de la COVID-19, inclosos els ingressos hospitalaris i la mort, però hi ha menys claredat sobre la protecció contra la infecció. Tot i que s'han informat estimacions d'efectivitat de la vacuna contra la infecció de fins a un 90 per cent, basades en proves rutinàries de persones simptomàtiques21, aquí informem una estimació de l'eficàcia de la vacuna contra la infecció del 63 per cent de REACT-1 rondes 13 i 14, quan dominava la variant delta.

Aquesta troballa és similar a la que es va informar a les dades enllaçades només per a les rondes 13,19 però combinant les dades de les dues rondes 13 i 14 també vam poder estimar l'efectivitat de la vacuna per al ChAdOx1 nCov-19 (Oxford-AstraZeneca) i les vacunes BNT162b2 (Pfizer–BioNTech) per separat. Tot i que els intervals de confiança es superposen, els nostres resultats suggereixen una major efectivitat contra la infecció amb la vacuna BNT162b2 (Pfizer–BioNTech) que amb la vacuna ChAdOx1 nCov-19 (Oxford–AstraZeneca). Diferències més grans entre vacunes es van informar en un estudi anterior22 i per Public Health England (ara l'Agència de Seguretat Sanitària del Regne Unit [UK HSA]) basades en proves rutinàries de casos simptomàtics.23 No obstant això, cal assenyalar que l'eficàcia de la vacuna és específica de la població. i temps, de manera que aquestes estimacions reflecteixen el rendiment de les vacunes a Anglaterra durant un període de temps específic (és a dir, juny-setembre de 2021). Des d'aleshores, la variant omicron (B.1.1.529) havia esdevingut dominant a Anglaterra el desembre de 2021, amb estudis de UK HSA que indicaven una menor efectivitat de la vacuna contra la infecció simptomàtica per omicron en comparació amb el delta.24

El nostre estudi mostra que la prevalença de la positivitat del hisop entre els individus no vacunats (inclosos tots els nens d'entre 5 i 11 anys) o els individus que van rebre una dosi de vacuna (inclosos els nens de 12 a 17 anys) va ser de tres a quatre vegades més gran que en persones amb vacunació doble. , però també suggereix que la prevalença de la positivitat del hisop indicativa d'infeccions innovadores després de la vacunació de dues dosis podria augmentar després de 3-6 mesos. A més, vam trobar que les persones que vivien en llars més grans i les persones que vivien en llars amb nens tenien taxes més altes de positivitat de l'hisop que les de les llars més petites o les que no tenien fills a la llar. La troballa dels nivells de prevalença ponderats més alts en la positivitat del hisop durant la ronda 14 en nens de 5 a 11 anys i de 12 a 17 anys planteja preocupacions per als nens clínicament extremadament vulnerables, així com per als contactes propers clínicament extremadament vulnerables, inclosos els membres de la llar i el personal escolar.

A finals de desembre de 2021, als nens clínicament vulnerables d'entre 5 i 11 anys se'ls oferirà dues dosis de vacuna. També hi ha preocupacions sobre els efectes sobre l'educació per al gran nombre de nens que han de no anar a l'escola quan donen positiu com a conseqüència de les altes taxes d'infecció per SARS-CoV-2. La constatació que la prevalença era més de tres vegades més gran per als individus de les llars amb un o més fills que en els individus de les llars sense fills suggereix que les infeccions en nens, no és sorprenent, es van estendre a altres grups d'edat. Les càrregues virals més altes associades a la variant delta en individus més joves en comparació amb les variants anteriors25–27 també poden augmentar l'eficiència de transmissió dels nens i, per tant, contribuir a augmentar les infeccions dins de la llar. El 27 de setembre de 2021, només 1214 (6,3 per cent ) nens d'entre 12 i 17 anys havien estat vacunats a l'estudi REACT-1, la qual cosa no permetia una extensió significativa de les nostres anàlisis d'efectivitat de la vacuna a aquest grup d'edat en ronda 14.

Es justifiquen estudis addicionals sobre l'eficàcia de la vacuna atès el ràpid augment de les infeccions per omicron a Anglaterra a partir del desembre de 2021 i el desplegament de vacunes de dosis dobles a escolars de 12 a 15 anys, dosis de reforç als 16 a 17 anys i en adults. de 18 anys i més. A més, estudis basats en la comunitat com REACT-1 permeten estimar l'efectivitat de la vacuna contra la infecció entre persones amb infeccions asimptomàtiques i simptomàtiques. Tot i que després de la campanya de vacunació hi ha hagut un desacoblament relatiu entre les infeccions per SARS-CoV-2 i els ingressos hospitalaris i les morts a Anglaterra2, encara hi ha preocupacions sobre el potencial d'alts índexs d'infecció i una immunitat incompleta de la població per provocar un augment del risc de patir complicacions greus de la COVID-19. Anglaterra, en comú amb la resta del Regne Unit i diversos altres països (sobretot Israel28), es va embarcar en una campanya per llançar terceres dosis (de reforç), a partir d'octubre de 2021, a Anglaterra. Inicialment, això va implicar la priorització d'adults de 50 anys o més, treballadors sanitaris i d'atenció social i persones més joves en risc, però el desplegament es va estendre posteriorment a tots els adults de 18 anys o més a finals de desembre de 2021.29 Seguiment continu de la L'epidèmia a Anglaterra i a altres llocs serà important per avaluar fins a quin punt les dosis de reforç en adults i la vacunació en nens redueixen la transmissió de noves variants preocupants del SARS-CoV-2, com ara la variant omicron.

El nostre estudi té limitacions. Des que l'estudi REACT-1 va començar la recollida de dades el maig de 2020, vam observar una reducció gradual de les taxes de resposta, del 30,5% a la ronda 1 a l'11,7% a la ronda 13. Tanmateix, a la ronda 14, la resposta la taxa va augmentar lleugerament fins al 12,2 per cent. Aquest augment, encara que petit, és encoratjador. Pot ser que nous canvis a l'enquesta puguin augmentar encara més la participació. El canvi a l'ús de hisops humits en solució salina i la recollida de mostres sense la cadena de fred (per correu postal o missatgeria) podria haver afectat la sensibilitat diagnòstica. Ens van tranquil·litzar les limitades diferències entre les mostres recollides per correu postal i missatgeria.

No obstant això, com que el sistema exacte utilitzat en les rondes anteriors (costoms secs i una cadena de fred sostinguda) no es va comparar al voltant, no vam poder estimar l'impacte del nou enfocament en comparació amb el utilitzat en les rondes anteriors. Una altra limitació és que no disposem de dades precises sobre l'estat de vacunació de tots els participants. Tot i que el consentiment per a l'enllaç de dades va ser a un nivell alt (87,5 per cent a la ronda 14), no tots els participants van consentir l'enllaç als seus registres de l'NHS, que inclouen dades del programa d'immunització COVID-19. Per a aquells les dades dels quals no estan enllaçades, les dades sobre les dates de vacunació i el tipus de vacuna falten o són menys fiables que a les dades enllaçades; per tant, vam basar les nostres estimacions de l'efectivitat de la vacuna en el subconjunt de participants amb registres vinculats. Aquest enfocament podria haver introduït un biaix en la mesura que aquells que accepten i no donen el seu consentiment a l'enllaç de dades poden diferir de maneres importants, com ara patrons de barreja social, que poden afectar el risc d'infecció.

A més, per a les nostres estimacions de l'eficàcia de la vacuna per tipus de vacuna, tot i que vam controlar l'edat i la ronda de la nostra mostra, l'amplitud de les diferències entre vacunes podria ser exagerada. Això es deu al fet que hi havia diferents patrons específics de l'edat en el lliurament de la vacuna (amb la vacuna ChAdOx1 n Cov-19 [Oxford–AstraZeneca] que s'havia administrat principalment a persones de 40 anys o més), així com diferències en dinàmiques de transmissió per als grups d'edat que van rebre les diferents vacunes. REACT-1 no va estar al camp durant l'agost de 2021, de manera que hi va haver un retard de gairebé 2 mesos entre el final de la ronda 13 el 12 de juliol i l'inici de la ronda 14 el 9 de setembre de 2021.

Tot i que és possible que les estimacions d'efectivitat de la vacuna puguin variar durant aquest període, no hem trobat proves d'una interacció entre els efectes rodons i de la vacuna. En conclusió, hem trobat evidència de l'augment de la prevalença de la positivitat del hisop entre els nens en edat escolar, així com una major prevalença de la positivitat del hisop entre 3 i 6 mesos després de la vacunació de dues dosis contra COVID-19 en adults. Els esforços en curs per vacunar els nens en edat escolar i administrar una dosi de reforç a tots els adults de 18 anys o més haurien d'ajudar a contrarestar qualsevol reducció de la immunitat tant a nivell individual com de població. A la temporada d'hivern a Anglaterra, l'NHS sol patir tensió per la grip i altres virus, i això s'ha agreujat durant el desembre de 2021, pel ràpid augment de les infeccions per omicron. Per tant, és important que el programa de vacunació mantingui una cobertura elevada, inclosos els reforços, i arribi a proporcions elevades de nens i adults no vacunats o parcialment vacunats per reduir la transmissió del SARS-CoV-2 i les interrupcions associades a la feina i l'educació.

Suplement de cistanche tubolosa: millora la immunitat

Referències

1 Comissió Paritària de Vacunació i Immunització. Assessorament sobre grups prioritaris per a la vacunació contra la COVID-19, 30 de desembre de 2020.

2 Riley S, Wang H, Eales O, et al. Informes de la ronda 12 REACT-1: el ressorgiment de les infeccions per SARS-CoV-2 a Anglaterra associat amb una freqüència més gran de la variant Delta. medRxiv 2021; publicat en línia el 21 de juny.

3 NHS Anglaterra. Vacunes contra la COVID-19.

4 Departament d'Educació del Regne Unit. Orientació: accions per a les escoles durant el brot de coronavirus. 2 de juliol de 2020.

5 Notícies de la BBC. Els primers alumnes escocesos tornen a l'escola per a un nou trimestre més enllà del nivell zero. BBC.

6 Riley S, Ainslie KEC, Eales O, et al. Ressorgiment del SARS-CoV-2: detecció per vigilància viral de la comunitat. Ciència 2021; 372: 990–95.

7 Riley S, Atchison C, Ashby D, et al. Avaluació en temps real de la transmissió comunitària (REACT) del virus SARS-CoV-2: protocol d'estudi. Welcome Open Res 2020; 5: 200.

8 Protocol de seqüenciació Quick J. nCoV-2019 v3 (Locost). 2020; publicat en línia el 25 d'agost. https://www.protocols.io/view/ncov-2019- sequencing-protocol-v3-Locost-bh42j8ye (consultat el 4 de maig de 2021).

9 Baker DJ, Aydin A, Le-Viet T, et al. CoronaHiT: seqüenciació d'alt rendiment dels genomes SARS-CoV-2. Genome Med 2021; 13:21.

10 [No hi ha autors llistats]. Un pipeline Nextflow per executar les eines bioinformàtiques de camp de la xarxa ARTIC. Github.

11 [No hi ha autors llistats]. Assignació filogenètica de Líniatges de brots globals amb nom (PANGOLIN). Github.

12 Sharot T. Ponderació dels resultats de l'enquesta. J Mark Res Soc 1986; 23: 269–84. 13 Hoffman MD, Gelman A. The no-U-turn sampler: ajust adaptatiu de longituds de camí a Hamiltonià Monte Carlo. J Mach Learn Res 2014; 15: 1533–623.

14 Bi Q, Wu Y, Mei S, et al. Epidemiologia i transmissió de COVID-19 en 391 casos i 1286 dels seus contactes propers a Shenzhen, Xina: un estudi de cohort retrospectiu. Lancet Infect Dis 2020; 20: 911–19.

15 Wallinga J, Lipsitch M. Com els intervals de generació configuren la relació entre les taxes de creixement i els nombres reproductius. Proc Biol Sci 2006; 274: 599–604.

16 Lang S, Brezger A. Bayesian P-Splines. J Comput Graph Stat 2004; 13: 183–212.

17 Oficina Nacional d'Estadística. Darrers coneixements sobre el coronavirus (COVID-19): infeccions. 7 de gener de 2022.

18 Departament de Salut i Atenció Social del Regne Unit. Comunicat de premsa: el Regne Unit passa a la següent fase del desplegament de la vacuna, ja que l'objectiu del govern arriba aviat. 13 d'abril de 2021.

19 Elliott P, Haw D, Wang H, et al. Creixement exponencial, alta prevalença de SARS-CoV-2 i efectivitat de la vacuna associada a la variant Delta. Ciència 2021; 374: eabl9551.

20 Agència de Seguretat Sanitària del Regne Unit. Variants preocupants del SARS-CoV-2 i variants que s'estan investigant a Anglaterra. Informació tècnica 25. 15 d'octubre de 2021.

21 Lopez Bernal J, Andrews N, Gower C, et al. Efectivitat de les vacunes Covid-19 contra la variant B.1.617.2 (Delta). N Engl J Med 2021; 385: 585–94.

22 Pouwels KB, Pritchard E, Matthews PC, et al. Efecte de la variant Delta sobre la càrrega viral i l'efectivitat de la vacuna contra les noves infeccions per SARS-CoV-2 al Regne Unit. Nat Med 2021; publicat en línia

23 Salut Pública Anglaterra. Informes de vigilància de la vacuna contra la COVID-19 (setmanes 19 a 38). 14 de maig de 2021.

24 Agència de Seguretat Sanitària del Regne Unit. Variants preocupants del SARS-CoV-2 i variants que s'estan investigant a Anglaterra. Informació tècnica: actualització sobre l'hospitalització i l'efectivitat de la vacuna per a Omicron VOC-

25 Jones TC, Biele G, Mühlemann B, et al. Estimació de la infecciositat durant el curs d'infecció per SARS-CoV-2. Ciència 2021; 373: eabi5273.

26 Bellon M, Baggio S, Jacquerioz Bausch F, et al. Cinètica de càrrega viral del coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la síndrome respiratòria aguda severa en nens, adolescents i adults simptomàtics. Clin Infect Dis 2021; 73: e1384–86.

27 Li B, Deng A, Li K, et al. Infecció i transmissió víriques en un brot gran i ben localitzat causat per la variant Delta del SARS-CoV-2. MedRxiv 2021; publicat en línia el 23 de juliol.

28 Bar-On YM, Goldberg Y, Mandel M, et al. Protecció del reforç de la vacuna BNT162b2 contra Covid-19 a Israel. N Engl J Med 2021; 385: 1393–400.

29 Agència de Seguretat Sanitària del Regne Unit. Vacunació COVID-19: una guia per reforçar la vacunació per a persones de 40 anys o més.